Como parte de su política de incentivo a la investigación, el IRA ofrece becas anuales dirigidas a sus grupos y a sus miembros ordinarios y asociados. En el 2012, gracias al auspicio de la Fundación Manuel J. Bustamante de la Fuente, se creó la beca “Riva Agüero-Bustamante de la Fuente” para tesis de licenciatura, y en el 2013 la correspondiente a tesis de de maestría en Historia.
El objetivo de estas becas es promover el interés y la vocación por la investigación entre los alumnos y egresados de la especialidad de Historia de la Pontificia Universidad Católica del Perú.